玉溪市抚仙湖、星云湖、杞麓湖的保护条例重点内容包括划定生态保护区域、实行分区管控、明确水质保护标准、强化各级管理职责、推动绿色发展等。具体如下：

一、划定生态保护区域

1、生态保护核心区：抚仙湖、星云湖、杞麓湖的生态保护核心区均指湖滨生态红线以内的水域和陆域。该区域实行最严格的生态保护制度，严格控制建设活动，引导人口和产业逐步退出，最大限度减少人为干扰，提升水生态系统质量和稳定性。

2、生态保护缓冲区：指湖滨生态红线与湖泊生态黄线之间的区域。该区域实行负面清单管控，减少人口、产业、建设用地、污染物排放总量，逐步退出与生态功能定位不符的开发性、建设性活动，增强湖泊生态净化、调节和修复能力。

3、绿色发展区：指湖泊生态黄线与湖泊流域分水线之间的区域。该区域需控制开发利用强度，调整开发利用方式，实现流域保护与开发利用协调发展，建设生态特色城镇和美丽乡村，推动绿色高质量发展。

二、实行分区管控

1、生态保护核心区：实行正面清单管控，除必要的生态保护、修复和科研监测等活动外，禁止其他任何可能破坏生态环境的活动。

2、生态保护缓冲区：实行负面清单管控，禁止新建、扩建与生态保护无关的建设项目，对现有不符合要求的项目逐步进行清理整顿。

3、绿色发展区：鼓励发展生态农业、生态旅游等绿色产业，推动产业结构优化升级，促进经济发展与环境保护相协调1。

明确水质保护标准

4、抚仙湖：水质按照国家《地表水环境质量标准》（GB3838—2002）规定的Ⅰ类水标准保护。

5、星云湖、杞麓湖：水质按照国家《地表水环境质量标准》（GB3838—2002）规定的Ⅲ类水标准保护。

6、入湖河道：水质按照水功能区水质目标分类保护。

三、强化各级管理职责

1、省人民政府：统筹领导湖泊保护工作，建立健全议事协调机制，综合协调解决重大问题，加强监督检查。

2、玉溪市人民政府：承担湖泊保护治理主体责任，统筹推进湖泊生态环境保护与经济社会协调发展，批准相关规划，下达保护治理目标任务等。

3、县级人民政府：负责本行政区域内湖泊保护工作，编制并实施相关规划，制定具体措施，组织领导相关部门和乡镇人民政府、街道办事处履行湖泊保护治理职责。

4、湖泊管理机构：宣传和贯彻执行有关法律、法规、规章和政策，审查相关规划，审查生态保护核心区的建设项目，查处违法行为，开展湖泊保护治理调查研究和水量调度等工作。

四、推动绿色发展

1、鼓励发展绿色农业，推广绿色种植、养殖技术，减少农业面源污染。

2、推动生态旅游发展，打造湖泊生态旅游品牌，促进旅游业与生态环境保护相融合。

3、加强湖泊流域生态环境修复，实施湿地恢复、植被修复等工程，提高湖泊生态系统自我修复能力。

这些条例的实施旨在通过严格的保护措施和科学的管理，确保湖泊的生态环境得到有效保护和改善，促进当地经济社会的可持续发展。